Perdonen ya lo resolví, después de ver mil y una vez y ver otros comentarios del foro, me introduje en los logs de el GlassFish encontrando asi que el verdadero error era que no tenia dentro del proyecto web la lib de MySql, jejeje un error torpe pero importante que me costo darme cuenta... gracias por el foro y todoooo genial, por fin funciona mi proyectoooo!!! soy feliz ... hay gracias a dios que lo encontré ya se me estaban yendo las esperanzas .
VAMOS ALLAAAAA!!!
el error es el siguiente.
java.lang.ExceptionInInitializerError
at controlador.NewHibernateUtil.<clinit>(NewHibernateUtil.java:55)
at controlador.Operaciones.validarUsuario(Operaciones.java:72)
at Actions.verificarUsuarioAction.execute(verificarUsuarioAction.java:39)
Si ejecuto el proyecto de Hibernate que tengo solito, funciona, pero desde el proyecto web puede ver las class de los controladores y esta bien compilar compila ... pero tira error en el hibernate util cuando se ejecuta.