Hola que tal.... estoy desarrollando un instalador en java.. pero me topado con algo que no tengo ni idea de como hacerlo... es de como colocar el aplicativo en Inicio y en el
Panel de Control(Opcion Desintalar) pero no se si eso se puedo hacer con la API java ... si es así me podrían ayudar de como implementarlo... Gracias

Buenas,

En la API java no hay nada para eso ya que lo que estás comentando es algo totalmente específico para Windows.
En mi opinión es mejor que preguntes en un foro de desarrollo en windows, ya que implica un conocimiento más o menos profundo del funcionamiento de dicho sistema (arquitectura ficheros, claves de registro, etc).
Tambien te puedes coger uno de los numerosos instaladores Java open source que ya están hechos como http://launch4j.sourceforge.net/ y ver como lo hace.
Por lo que observo por tus preguntas haces unos desarrollos totalmente específicos para el SO de Microsoft... ¿Has probado .NET?

Un saludo,