Me gustaría desarrollar una aplicación java con conexión a una base de datos mysql y entorno Windows. Hice hace un par de años un curso de java básico así que a día de hoy mi nivel es inicial. ¿Cuál es el mejor entorno para desarrollar esta aplicación? Si algún día quiero utilizar la aplicación en un entorno empresarial distribuido, ¿cambia la decisión?

Por lo que he entendido leyendo por ahí, es que Java SE está más enfocado al desarrollo de aplicaciones en cliente mientras Java EE es más para aplicaciones servidor. Puede que ahora quiera desarrollar la aplicación para que corra en una máquina, pero que en un futuro me interese más que se pueda ejecutar en dos o más oficinas y que se comuniquen entre ellas. Si desarrollo la aplicación en Java SE, ¿podría coger el mismo código y seguir desarrollando con Java EE sin problemas?