Estoy haciendo un programilla bastante simple en java, el programa lo único que hace es que a partir de un direccion web (URL) descarga el contenido html a local en txt, resumiendo lo que viene siento un "Guardar como" desde cualquier navegador, que te descargas la web a local.
Pero en este caso quiero que lo haga un programa externo. y va bien hasta toparme con este estilo de web:

El problema que tengo es que por ejemplo en la web de EXPEDlA le paso una direccion web ( la dirección de ejemplo se encuentra en el código en la web de pastebin ) al programa y se descarga la web correctamente pero se descarga digamos el html estatico, luego hay otro dinamico que muestra un mensaje de "Estamos procesado su información" y al cabo de X segundos muestra los precios de los viajes, pero el programa de java no espera a esa informacion y me descarga la web de tal forma que la web que me descarga es esta.

La imagen se puede ver aqui:
http://s2.subirimagenes.com/imagen/previo/thump_8769244expetia.png

¿Alguien sabe como podría descargar la web pero con toda la informacion?
Es decir que se descargue cuando la web haya mostrado la solicitud de petición?

tampoco se si es posible hacerlo para este tipo de webs, porque con web normales funciona.

Adjunto la clase java en el link de abajo.

http://pastebin.com/ABzXUeM5