Sin ver nada del código que estás usando, prueba con setOpaque(false)
Si no funciona, te sugiero que publiques aquí tu código, porque depurar a ciegas es "algo complicado" :)
para que estas ocupando los paneles solo para mostrar una imagen?? si es asi podrias ocupar mejor labels y en ellos mandas a llamar las imagenes
Hola gente tengo una consulta si alguien me puede dar una mano se los agradeceria estoy usando awt creo graficos en dos paneles y necesito poner uno sobre el otro y que se vean ambas imagenes como puedo hacer para sacar elk fondo sin borrar las figuras . gracias saludos (estoy usando Java)