Mass-Up es una herramienta open source para análisis de datos de espectrometría de masas por MALDI-TOF 100% hecha en java.
Las características principales son:
- 100% Java.
- Software libre.
- Basada en el framework AIBench (http://www.aibench.org/).
- Carga de datos de MALDI-TOF desde diferentes formatos como mzML, mzXML y CSV.
- Funciones para preprocesamiento (basadas en llamadas a librerías de R), que incluyen normalización, suavizado (smoothing), corrección de linea base (baseline correction), detección de picos (peak detection) e identificación de picos comunes (peak matching).
- Soporte para la fácil aplicación de diferentes tipos de análisis a los datos. Entre los análisis se incluyen: clustering jerárquico, biclustering, descubrimiento de biomarcadores, control de calidad, análisis de componentes principales (PCA) y análisis de clasificación.
Nota: noticia enviada por hlfernandez